fredag 18 december 2009

Open Access är för allmänhetens skull - också

(Alternativ titel: It so totally is! Neener, neener!)

Christina Moberg har publicerat en debattartikel i Tentakel om Vetenskapsrådets krav på Open Access-publicering och VA-bloggen har kommenterat. Det är en intressant debatt, eftersom båda sidor har helt rätt, även om de är ganska orättvisa. I runda slängar ser det ut så här:

Moberg befarar att kvaliteten på publikationer kommer sjunka med Open Access. Kärnan i hennes kritik är att hon befarar att peer-review-systemet kommer urholkas. Om detta skulle inträffa får man säga att hennes kritik mot Open Access är berättigad, eftersom svenska forskare i så fall skulle vara bundna av VR att publicera i andrahandstidskrifter. Som Open Access-kramare kan PK tänka sig ett antal anledningar till att detta inte kommer att ske. Till att börja med är kvalitetsbedömning av vetenskapliga publikationer reciprok. Det finns massvis av traditionella tidskrifter som också slarvar med sin peer review, men få seriösa forskare bryr sig om dem. Det är rimligt att anta att samma sak kommer inträffa med Open Access-journaler, och det finns en hel del som pekar på att det redan skett. Vidare så, som Moberg själv påpekar "står och faller [vetenskapen] med peer review som förmår skilja vederhäftig forskning från strunt och plagiat." Skulle funktionsduglig peer review hotas skulle forskare (som ibland klarar av att tänka helt själva) tvingas välja mellan att sluta med Riktig Vetenskap eller att Lösa Problemet. Det senare är i princip det enda forskare faktiskt är kompetenta att göra, så man kan gissa hur det kommer sluta, om det alls inträffar. Det mest realistiska, om nu Mobergs worst case inträffar, är att VR kommer göra sig själv irrelevant.

Så till VA-bloggens invändningar mot Open Access, där skribenten Karin "tror att Open Access i och för sig är positivt på många sätt, men att artiklarna inte är skrivna så att den som inte själv är forskare (eller ovanligt insatt) förstår." PK tycker det är ett intressant påstående, eftersom det lämnar en del frågor att besvara.

Till att börja med bör kanske Mobergs påpekande att vetenskap står och faller med sina peer-reviewade artiklar upprepas. Anledningen till detta är att ur praktisk synvinkel är dessa artiklar forskningen. Man kan ompackettera vetenskapliga fynd på många sätt (Oh! Oh! JULKLAPPSTIPS!) men populärvetenskap, seminarier och öppethus-dagar och andra jippon i all ära: De är inte forskning. Vill man göra forskning mer tillgänglig för allmänheten finns exakt två sätt: göra primärkällan mer tillgänglig eller få fler att forska själva (dvs. att sluta vara allmänhet). That's it. Hur mycket PKs labb än är med i vetenskapsradion, skriver debattinlägg, håller öppna föreläsningar riktade till Svensson och välkomnar vem som helst att titta förbi så kvarstår följande: Vetenskap börjar och slutar i peer review, allt annat är dekorationer. Det som inte görs för att blidka en reviewer är inte forskning.

VA-bloggen reser också invändningen att folk faktiskt inte gillar att läsa, utöver att de också är okunniga. Det är en underlig invändning. Det är i och för sig så att bara den som är "ovanligt insatt" kan tillägna sig (t.ex.) PKs nyss utkomna pek, men då bör man också komma ihåg att det nog är lika ovanligt att någon icke-forskare (Hej Mamma!) ens skulle vilja veta vad som står i det. Den smått fantastiske och likaledes populärvetenskaplige författaren David Shenk sade så här om sina böcker:

These are not things that people actually want to read about. They are things that people are interested in -- as in, "Ah, tell me more about information proliferation as you pour me another tall glass of excellent scotch." Being interested is not the same thing as wanting to read a book about something. Trust me on this.


PKs forskningsområde är löjligt komplicerat. Han kan skriva en anständig text eller hålla en ganska kul och förklarande föreläsning om det som många, men inte alla, skulle förstå. Lite titt som tätt har en del ännu bättre pedagoger än PK fått för sig att skriva eller prata på just detta sätt. Affischer har tryckts. Blankare har satts in. The word has hit the street. Resultatet (och det här är vem som helst välkommen att testa, det är ett av många forskare bekräftat resultat) blir att ingen kommer, ingen läser. Ämne spelar ingen roll. Hur pass bra på att prata du är spelar mycket liten roll. I slutänden är den bästa spridaren av vetenskap i Sverige (och detta svider för många forskare) DN och kvällspressen. Det kan låta nedlåtande (även om PK råkar tycka att DNs vetenskapsartiklar faktiskt är bra), men om man ser sig om inom t.ex bloggosfären vad folk har att säga om vetenskap är det med en förstummande hög grad som deras källor är just dessa, Google eller deras egna spekulationer. Forskare är intressanta om de kan bidra med en färgglad film där massvis av spektakulära saker händer, men förklaringen av vad som händer i filmen är både opublicerbar och, i slutänden, ointressant för de allra flesta.

Och detta är helt okej. PK kan i princip ingenting om arkitektur, konsthistoria eller svetsning, utöver det uppenbara faktum att andra människor verkar ha goda skäl att tycka att det är både viktigt och/eller roligt, och det är helt okej att han aldrig kommer få någon slags förståelse av dessa ämnen. Det som är viktigt med VRs krav på Open Access är att om någon faktiskt får för sig att sätta sig in i något så ska det gå. Prenumerationskostnaderna ska inte behöva vara ett hinder för kunskap när svårighetsgraden redan är ett så stort hinder. Vill man, av någon anledning, läsa på (Och jo, Karin, man måste läsa. Är man inte beredd att läsa om vetenskap är det ett sunt antagande att man helt enkelt inte är så himla intresserad i alla fall.) om ett visst ämne har man ett ganska stort jobb framför sig innan man kommit till forskningsfronten, så det är en mycket bra sak att allmänheten i alla fall inte ska behöva punga ut med särtryckskostnader eller bo i en universitetsstad.

tisdag 15 december 2009

Samhall och ätpinnar

Det finns få saker som är så tillfredställande som att släppa lös en riktigt värdelös vetenskaplig artikel på en grupp intet ont anande forskare och njuta av kaoset som följer. PK kan vid ett eller två tillfällen ha gjort sig skyldig till denna synd. Rätt ofta handlar det om en artikel från Medical Hypotheses.

För att förtydliga, MH är inte en vetenskaplig tidskrift i ordets rätta bemärkelse, i och med att den saknar peer review och publicerar artiklar som oftast helt saknar faktiska resultat, utan enbart spekulationer. På sin hemsida beskriver tidskriften sig så här:

Medical Hypotheses takes a deliberately different approach to review: the editor sees his role as a 'chooser', not a 'changer', choosing to publish what are judged to be the best papers from those submitted. The Editor sometimes uses external referees to inform his opinion on a paper, but their role is as an information source and the Editor's choice is final. The papers chosen may contain radical ideas, but may be judged acceptable so long as they are coherent and clearly expressed. The authors' responsibility for the integrity, precision and accuracy of their work is paramount.


Det som byggt tidskriftens rykte är alltså dessa "radikala idéer", vilket allt som oftast är en omskrivning för stolliga fantasier. Det finns antagligen mer än en skribent som skrattat gott när han eller hon skickat in ett bidrag. På det stora hela liknar den Annals of Improbable Research eller Journal of Irreproducable Results, med undantaget att det finns de som tar MH på allvar. Det är nu det börjar bli knepigt.

Det började i höstas när ett stort antal av världens ledande AIDS-forskare publicerade ett öppet brev där de krävde att MH skulle avlistas från MEDLINE, den databas där all forskning som kan tänkas spela någon roll inom medicin läggs upp. Anledningen var främst att MH på senare tid blivit en megafon för den rörelse som fortsätter förneka kopplingen mellan HIV och AIDS, vilket både saknar vetenskaplig grund och orsakat mycket lidande i tredje världen där vissa regeringar valt att följa förnekarnas linje.

Det hela skruvades upp ett snäpp när Pharyngula till slut valde att publicera en sågning av en artikel från MH skriven av editorn själv. Artikeln i fråga innehöll denna lite smått geniala idé:

If technologies are devised which can conveniently and safely engineer genes causal of spiritual and religious behaviours, then people may become able to choose their degree of religiosity or spiritual sensitivity. For instance, it may become possible to increase the likelihood of direct religious experience - i.e. 'revelation'


Att bli sågad på en av nätets populäraste bloggar var mer än editorn var bered att bjuda på och snart var ordkriget igång.

Snabbspola till idag.

Av någon anledning har denna artikel från 2006 börjat snurra runt på nätet. Eftersom PK älskar udda artiklar blev han förstås tvungen att läsa den och han blev inte besviken. Han har sett artiklar som bevisar Guds existens (det finns många). Han har en om en ung man som drabbats av spontant pneumothorax när han var ute och körde motorcykel. PK har en utskrift av en artikel som förklarar den fysiologiska mekanism som ligger bakom drakars förmåga att spruta eld.

Detta är den dummaste artikel han sett. Den mest rasistiska. Den är inte på skämt. I give you:

Down subjects and Oriental population share several specific attitudes and characteristics
[...]
Some attitudes and any daily habitus observed in Down subjects, recall those of the oriental population.


Yes box. Ostasiater och personer med downs syndrom; inte så olika. Författarna går igenom ett antal drag som delas mellan de två grupperna, bland vilka de minst förolämpande detaljerna är de "apliknande händerna" och att de gillar att duka upp många små rätter på bordet vid måltider, men kronan på verket är följande:

The tendencies of Down subjects to carry out recreative–reabilitative activities, such as embroidery, wicker-working ceramics, book-binding, etc., that is renowned, remind the Chinese hand-crafts, which need a notable ability, such as Chinese vases or the use of chop-sticks employed for eating by Asiatic populations.


Sug på den en stund. Personer som jobbar på Samhall är typ asiater. För det är typ som att äta med pinnar.

Typ.

PK kommer aldrig bli insläppt i lunchrummet igen.

måndag 14 december 2009

EEG är så nittonhundratal

Dags för en stund med alla akademikers favoritsällskapslek: Att racka ner på andra akademiker.

EEG. (Konstpaus för att låta PK dra ett dramatiskt andetag.) Det går att mäta en viss grundläggande hjärnverksamhet med skalpelektroder, och om man inte har för höga krav kan man använda mätningarna till att göra vissa mycket enkla grejer. That's it. Det var en nyhet på 1920-talet och har inte utvecklats nämnvärt det senaste halvseklet. Kan vi snälla komma över det nu?

Så. Mycket bättre. Hur som helst verkar det råda inflation på att bli oproportionerligt imponerad av EEG på sistone. EEG-spel för alla de gamers därute som är trötta på praktiska spelkontroller. Time Magazine rankade nyligen Twitter med EEG som årets nionde viktigaste innovation. För att förtydliga, så är alltså årets nionde viktigaste innovation att koppla en femtio år gammal grunka till en PC och skriva en mening som mycket enklare hade kunnat skrivas med en annan gammal uppfinning, tangentbordet. (Till Times försvar bör påpekas att de rankar det elektroniska ögonimplantatet (en mycket tuff och på många sätt revolutionerande grunka inom sitt fält) som nummer tio.

Via den transhumanistiska bloggen Människaplus har detta dykt upp:



Till skillnad från den jämngrå EEG-massan gör forskarna i filmsnutten i alla fall ett ganska intressant påstående: Att de lyckats koppla ihop två hjärnor direkt. Synd bara att det inte är vad de gjort. De har låtit en person skicka en EEG signal till en dator som producerar ett visuellt stimuli för en annan person, som förstås ger utslag på ett EEG det med. *tumbleweed*

I brist på glass har PK letat reda på följande filmsnutt för att det här inte ska förvandlas till ett renodlat gnällinlägg. Mina damer och herrar, ett gäng galna australiensare:



Läskig musik: Check. Absurt invecklad elektronik: Check. Bilder på ögon som är uppspärrade så mycket att det måste vara obekvämt: Check.

Uppdatering om Phelps minnesstudie

Under helgen har studien om modulering av minnen PK skrev om i fredags börjat dyka upp lite varstans. Först dök den upp i Neuroethics at the Core, där man totalt missat poängen med studien och lägger fram följande invändning:

But the interesting question from the perspective of neuroethics is this: does it really make the process of therapeutic forgetting any less worrisome when the manipulation is behavioural rather than pharmacological? I would suggest that many people would say yes. Certainly the issue of safety is sidestepped, but I suspect that this is not the essence of most people’s concerns. Rather, I believe that we have an aversion to using chemicals to manipulate our brains [...] while we seem rather comfortable with manipulating our brains by behavioural measures. One plausible hypothesis is that the behavioral manipulation somehow seems more natural to us. But as any keen observer of neuroscience knows (and indeed, as the reconsolidation hypothesis demonstrates), every experience that we have changes the underlying chemical makeup of our brains. So is it so different after all?


Nu är PK inte etiker, men kärnan i argumentet verkar vara att eftersom hjärnan gör sina hjärngrejer i egenskap av kemisk maskin är all påverkan av den att likställa med farmakologisk påverkan, eftersom den är kemisk. Cirkulära argument är cirkulära. Finns det något stimulus alls som inte diskvalificeras av det här resonemanget? Neuroethics at the Core länkar dock till en intressant artikel i Vanderbildt Law Review (PK gör juridik, yo!) där följande stycke dyker upp:

There is little evidence so far as to how much, if at all, propranolol affects the informational content of traumatic memories formed before the drug is consumed. Assume, however, that propranolol or a future memory-dampening drug dampens both informational and emotional aspects of memories. If a witness to a recent gruesome crime uses such a drug, it will have two effects: First, it will ease the witness’s suffering and help him resume a normal life. Second, it will reduce the socially-valuable information contained in the witness’s memories—information that may be vitally important to prosecuting the perpetrator and protecting others from harm. These two effects reveal a tradeoff that memory dampening may pose between our individual autonomy interests in controlling what happens to our bodies103 and society’s interest in preserving evidence that benefits others.


Ett par saker är slående med ovanstående citat. Det första är förstås att jurister bör hålla sig till juridik. Någon som tror att det är svårt att får minnen att försvinna, eller att detta ligger någonstans i framtiden, bör kanske överväga att inte skriva om neurofysiologi. Det andra är att det antas att emotionella minnen skulle försvinna tillsammans med deskriptiva sådana, som bieffekt eller med avsikt. Det finns ingen egentlig anledning till att koppla ihop de två, så ett lika relevant exempel hade varit ett medel som tar bort emotionella aspekter av minne och som ger folk parkinsons sjukdom eller gör dem färgblinda. Eller lär dem tango. Varför är det alltid samhällsvetare och filosofer som får bestämma vad som är relevanta metaforer för hjärnforskning?

Även Metro har skrivit ett par rader om studien, vilket kan summeras med chockrubrik, vitsar om att supa bort sina bekymmer och att, till skillnad från DN, totalt missförstått vad studien handlar om eller vetenskapen bakom den. Jag ska sluta gnälla på våra morgontidningar.

Priset för mest originella post om Phelps studie får i alla fall den här snubben. Det är något om hjärnimplantat och att ersätta minnen och datorer som läser folks tankar som jag misstänker framstår som fullständigt logiskt i exakt en persons huvud, men det enda som spelar någon roll är den helt geniala frisyren.

torsdag 10 december 2009

Fear extinction i DN

Efter en dags misslyckade labbar och oenigheter med hr. Professorn råkade PK igår kväll snubbla över DN vetenskaps senaste artikel. (DN, allt är förlåtet. Bär mina barn.) Om man bortser från den efterblivna rubriken (Hett tips: att haussa en studie med motiveringen att den visat att "hjärnan kan omprogrammeras" är inte så lyckat, med tanke på att det är ett organ vars definierande egenskap är att kunna omprogrammeras.) så rapporterar den inte bara om något PK tycker är intressant, den är rätt välskriven också.

Lång historia kort:För ett par år sedan råkade man mer eller mindre av en slump upptäcka att en av de äldsta kärlmedicinerna på marknaden också kan blockera skräckupplevelser förknippade med traumatiska minnen. Stor uppståndelse, spännande djurförsök, osv. Nu har en forskargrupp i New York upprepat effekten på människa utan att använda några läkemedel. Genom att lära försökspersoner att vara rädda för ett stimulus genom att para det med elstötar. De försökspersoner som fick utsläckningsträning (dvs. stimulus utan stötar) tio minuter efter den första träningen försvann rädslan. De som fick utsläckningsträning sex timmar senare visade inte samma effekt.



Intressant om effekten visar sig vara rubust. Så fort våra associativ inlärnings-personer lagt av med att ha svininfluensa (ett jävla osätt) måste PK fråga dem vad de tycker.

tisdag 8 december 2009

Årets klagomål på Nobelstiftelsen

Eftersom det snart är dags att dela ut Nobelpris är det också högsäsong för att göra politik av utdelningen. Analytical Chemistry publicerade en debattartikel om kemiprisets vara eller icke vara för ett tag sedan, men antog en ganska förlåtande hållning:

[The] Nobel Prizes continue to play an important role in science and society by providing a dependable platform for the mass media to discuss basic science. [...] Each chemistry prize, in turn, brings a subdiscipline within the field to the attention of all chemists.


På det stora hela tonar författaren ner de sedan länge färdigältade sanningarna om att svårbegriplig vetenskap är svår att begripa och den i grunden underliga idén med ett pris för vetenskap. Kanske sant, men inte lika underhållande som förra årets kritik av att användbarheten hos fynd som inbringat Nobelpris verkar sjunka:

Other extremely beneficial inventions for mankind, such as the paper clip or the condom, did not receive the Nobel Prize and likely never will. This is mainly due to the fact that physics does not consider them to be part of its field.


Lyckligtvis finns Djurens Rätt, som genom ett samarbetsorgan skrivit ett öppet brev till Nobelstiftelsen. Klagomålet består i att enbart framgångshistorier uppmärksammas med priset, vilket de anser mörkar antalet djur som sätter livet till i misslyckade djurförsök. Självklart bifogas en lista med krav på Nobelstiftelsen, vilket är helt rimligt med tanke på hur villig den har varit att tillmötesgå krav i det förflutna (Hej på dig, Astrid Lindgren!):

The ECEAE urge the Nobel Foundation to put ethics on the agenda, by:
1. Including an ethical discussion about animal experimentation when investigating possible
candidates (mainly applicable to the Prize for Physiology and Medicine)
2. Facilitating development and use of alternatives by forming a new body under the Nobel
Foundation, with the purpose of acknowledging and awarding non animal methods.


Djurens Rätt har också gått ut med en press release. Man får anta att det är mer gem-och-kondomforskning DR efterlyser, men det är inte helt lätt att förstå vad de vill (bortsett från att djurförsök är dåligt, dårå). Det är lättare att peka på vad man inte gillar än att föreslå något bättre.

Vilket för oss till Conservapedia. Ge priset retroaktivt till Ronald Reagan!

måndag 7 december 2009

Och lite Brain-Machine Interface...

Det ser ut som Smarthand-folket i Lund har fått konkurrens:



Handen i fråga ser påtagligt likartad ut. Skulle vara roligt att veta om det är samma eller om det finns något slags sammarbete. Uppdaterat: PK har frågat. Det är samma hand.

Hur som helst: Yeay BMI.